本課程以公衛學院，醫學院研究生及大學部高年級生為對象。為本所環境職業醫學組必修，2學分。使用教材為台大醫學院出版委員會出版之王榮德著『流行病學方法論』。其主要目標在訓練學生的科學研究思考方法。先從科學方法的基礎『猜測與否證』講起，談到因果關係之判定，測量之基本原理。逐步進入流行病學之基本測量，研究設計，率之標準化，抽樣原理；然後再談追蹤研究法及個案對照研究法。最後再談如何閱讀及批評一篇研究論文。近年來流行病學方法在計量健康效用(utility)上有大進展，直接可被用於醫療及衛生決策與成本效用分析；這是書上尚未談但本課會有簡單介紹其觀念。